O modelo de conservação adotado deu ao Projeto Tamar e sua equipe de pesquisadores prestígio e reconhecimento, no Brasil e no exterior, e vários prêmios. Entre os principais, destacam-se os seguintes:
Prêmio Top de Qualidade - 2004
UNESCO – 2003
Ernest Young – 2003
Honra ao Mérito - 2003
Spirit de Excelência Náutica – 2003
Náutica – 2003
Ecoturismo – 2003
Assembléia Legislativa do Espírito Santo – 2002
Ateneu 2002
Heroes of the Planet – 1998
J. Paul Getty - 1997
Troféu Axé - 1996
Ordem do Mérito da Fraternidade Ecumênica - 1996
Prêmio Muriqui - 1996
Prêmio Science for Conservation - 1994
Selo Social ODS – 2020
ISTS Lifetime Achievement Award – 2018